此外，中原向西南的道路交通不便（可曾记得李白的《蜀道难》），大军难以快速通达，粮草供给易被切断。长期封闭管理下出现的土司等地方势力极度排外。在大明之前，南宋抗元的防务正是在此地设立，直至蒙古西征结束而战斗不止。蒙古强征大理打通要道，多路大军直接围剿云南诸国，并在此后统治年间不断派兵清扫战场。战后，云南被元朝统治者所掌控，在大明建立后仍负隅顽抗。太祖朱元璋在和谈无效后令蓝玉、傅友德等开国大将分两路强攻云南。
由于明朝大军征伐并非良久之计，况且云南、贵州地处偏僻，但地理位置极为重要，把守大明王朝向印度半岛的咽喉要道。因此，进一步的统治管理势在必行。太祖令沐英常驻此地管辖地方事务，后者在此地立下家族、兴修水利、四处平叛、开通交通要道、传播中原儒家文化，病逝后被封王以祭奠功绩。此外，为保证大明王朝与此地文化语言沟通无碍，沐英奉朱元璋的命令将周边江苏、湖广地（正好是元末张士诚、陈友谅的割据地，分化当地忠于他的群众不亦乐乎）的百姓迁移到云贵地区，并将所携带的大军驻扎在这里，设立军屯和卫所，开荒土地。
